一个PCT专利申请要历经国际阶段和国家阶段。

国际申请先要进行国际阶段程序的审查，随后进到国家阶段程序审查。申请的提出、国际检索和国际初步审查在国际阶段完成，是不是授予专利权的工作在国家阶段由被指定的每个国家局完成。

国际阶段

1．提交国际申请

1）通常情形下，PCT申请应向作为PCT受理局的国家局提出。PCT专利申请人在申请的同时，就需要指定该申请将在哪些成员国有效，这一些被指定的国家称之为"指定国"。

2）中国国家知识产权局作为PCT指定受理局，只接受中国的国民或居民提出的国际申请，国际申请中有多个申请者时，少有个申请者的国籍或居所是中国。中国国家知识产权局接受中文、英文两类语言。

3）国家知识产权局受理PCT申请后，将对所申请的文件进行形式审查，觉得专利申请文件和专利申请手续完备的，即确认国际申请日。国际申请日表明自该申请之日起，PCT国际申请在每一个"指定国"具备相当于正规的国内申请的效力，该申请日也成为了在某指定国的实际申请日。

4）审查符合标准后，则将申请文件分别送交世界知识产权组织国际局和国际检索单位。

2．国际检索

1）国际检索是一个封闭式的过程，除单一性或明显错误的问题外，申请者与检索单位并没有什么交流。自优先权之日起9个月，或自检索单位收到检索本起3个月，之后到期的时间为标准，检索单位会制定检索报告或在某些情形下宣布不制定检索报告。检索报告或宣布将传送给国际局和申请者。

2）国际申请日（或优先权日）起满18个月后，国际局将公布PCT国际专利申请和国际检索单位作出的检索报告，并将该申请连着检索报告送交该PCT专利申请要求的"指定国"的国家专利局。

3．国际公布

1）自优先权之日起18个月满时，国际局将对国际申请进行国际公布。

2）出版物有两类：小册子和公报。公布形式包含纸件和电子件。

4．国际初步审查

1）《专利合作条约》规定，国际初步审查程序并不是强制性的。

2）国际初步审查只就发明是不是具备新颖性、创造性和实用性提出初步的意见，其审查意见对每个指定国并没有任何约束力。

3）在该阶段，申请者可对其申请文件进行主动修改，也有可能会收到国际初步审查单位发出的书面形式意见，申请者可以阐述自身的观点或进行修改。

4）在优先权之日起28个月时，国际初步审查单位会制定国际初步审查报告，并传送给申请者和国际局。

国家阶段

1）进行完国际阶段后，经过申请者申请启动，国际专利申请进到国家（或地区）阶段。

2）申请人需要在自优先权日30个月（在某一些国家可能是20个月）内办理进到指定国（或选定国）国家阶段的手续：缴纳国家费用，提交翻译成该国语言的国际申请的译文。

3）因法规各有不同，有一些国家进到国家阶段的时间会晚于30个月（或20个月）。

进到国家阶段的时间是需要遵守的，即使国际初步审查报告并未获得。在国际阶段中没有在自优先权之日起19个月内要求国际初步审查的国际申请，其进到国家阶段（指定局）的时间是自优先权之日起20个月；在自优先权之日起19个月内提出国际初步审查要求的国际申请。

国家阶段在申请人希望获得专利权的国家的专利局里进行。他包含办理进到国家阶段的手续和在各指定局或选定局里进行审批程序。

进到国家阶段后，需要按照规定提交国际申请文件的译本（该国的官方语言）和缴纳规定的国家费用。随后由专利局按其专利法规规定对其进行审查，并确定能否授予专利权。